联邦九十九年，叛离联邦十三年的千年号星际战舰归降联邦，大司令被副将袭杀而亡，反联邦联盟由攻转守，反政府阵营由明转暗，无奈之下，联邦展开了“清水行动”和“除菌计划”。而星盗在这种大势下只得在夹缝中生存，其中一个少年在这星际乱世拙壮成长，成为天选之星，带领星盗周旋于联邦和反联邦联盟之间，这是一个机甲重生挑战战舰的大时代，也是各种意识形态相互碰撞的大时代。